法国疫情由当地不明毒株引发
法国新冠肺炎样本单核酸多态性发作部位比较图。  图片来历:巴斯德研讨所论文截图  4月28日,法国巴斯德研讨所发布新闻布告,该所已完结“法国输入性与前期传达病毒的朔源剖析”相关研讨,成果于近来以预发表方式发布在bioRxiv.org网站。依据该研讨,法国爆发的新冠肺炎疫情并不是由1月份来自我国的输入病例引起的,也并非来自意大利,而是来自一种在当地传达的来历不明毒株。该研讨由法国国家呼吸道感染病毒参阅中心主任西尔维·范·德维尔和巴斯德研讨所RNA病毒进化基因组学担任人埃蒂安·西蒙·洛里埃一起牵头。  依据巴斯德研讨所供给的新闻稿,法国于1月10日开端病毒监测,由巴斯德研讨所和法国呼吸病毒研讨所(NRC)担任发动亲近重视流程。法国于1月24日发现首例新冠病毒感染者,这也是欧洲首例新冠肺炎患者,还有其他两例我国输入性患者也很快被检测和收治。法国政府敏捷采纳办法,追寻了这些患者的亲近拆阅者,阻挠了病毒的进一步传达。1月份的我国输入病例没有在法国引发部分传达,显示出法国采纳防备病毒分散系列办法的有效性。  法国收集的新冠病毒样本均储存在国家呼吸病毒研讨所,巴斯德研讨所RNA病毒进化基因研讨组对97份法国病毒样本进行了基因测序与比对。样本首要为鼻咽拭子和痰液,采样时刻为1月24日至3月24日。法国该阶段确诊病例22302人,逝世1100人,疫情首要盛行于法国北部。悉数样本均采自于有临床症状的确诊患者,一起将原籍、游览史、发病时刻、病毒载量和采样部位归入基因比对内容。还有3份来自阿尔及利亚病毒样本。  欧洲精准医疗渠道首席科学家鞠丽雅对该溯源研讨进行了解读:取自法国东南部并有意大利游览史的病毒株(GE1583,B2340)与法国北部的不同,但和意大利北部盛行株相似,并且没有在法国盛行;法国首例来自我国的确诊患者(IDF0372),其单核酸多态性G22661T是独有的,与法国的一切病毒基因不同;法国北部区域的代表性病毒基因为GE1973(东大区域),IDF2849(大巴黎区域)和N2223(诺曼底区域);有欧洲游览史的代表基因为IDF2792;3份取自阿尔及利亚的病毒株与法国北部盛行株同源。  巴斯德研讨所将法国检测的样本序列与全球同享流感数据建议安排(GISAID)发布的338份新冠肺炎病毒序列进行比对和溯源剖析,并树立病毒进化树图谱。比照研讨标明,法国盛行的新冠病毒和1月发现的我国输入感染病毒并非来自同一毒株,两种病毒来自同一个“先人”,但归于不同的分支。导致法国本地疫情的干流分支,与来自我国和意大利的输入病例都不相同。法国如今盛行的病毒样本中,最早一个样本是2月19日从一名患者身上收集的,该患者没有国内外游览史,也没有和海外归国的游览者拆阅过。该患者于2月25日逝世,随后法国呈现大规模疫情潮。  鞠丽雅对科技日报记者表明,来自亚太区域(包含湖北武汉)的病毒株与法国病毒株没有相关;来自美国病毒株与法国的相关不大;法国北部盛行病毒株均出自于同一原始株。用浅显的话来解说,法国新冠病毒是一个前史长远的大家族,和我国武汉的病例相隔甚远。  归纳上述成果,巴斯德研讨团队提出,因为最有代表性的基因型的最早病例并没有游览史,意味着早在2月份欧洲疫情爆发之前,已经有病毒在法国和欧洲其他国家“悄然”盛行,且大部分是轻症或无症状,因而长时刻未被发现。这项作业为法国病毒溯源供给了头绪,并强调在无症状病例很多存在的情况下,遏止病毒传达面对应战。  巴斯德研讨所指出,许多国家的病毒取样作业依然不完全,因而无法准确估算出法国新冠病毒的来历或输入时刻。蒂安·西蒙·洛里埃指出:“依据咱们的初次调查,法国盛行的新冠病毒感染与无症状病例有关。对不同区域的新冠病毒进行测序很重要,能更好地了解法国新冠病毒的盛行轨道。”

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